Kabupaten Klungkung är ett kabupaten i Indonesien. Det ligger i provinsen Provinsi Bali, i den sydvästra delen av landet, 1,000 km öster om huvudstaden Jakarta. Antalet invånare är 170,543. Kabupaten Klungkung ligger på ön Nusa Penida.
Tropiskt monsunklimat råder i trakten. Årsmedeltemperaturen i trakten är 24 °C. Den varmaste månaden är oktober, då medeltemperaturen är 28 °C, och den kallaste är juni, med 22 °C. Genomsnittlig årsnederbörd är 2,123 millimeter. Den regnigaste månaden är januari, med i genomsnitt 569 mm nederbörd, och den torraste är september, med 23 mm nederbörd.